药房自动化系统通过自动化设备接收信息系统，凭借机器或装置按发药程序或指令，自动进行加药、配药、发药及其它有关药房工作的房间。

患者缴费后拿处方单到窗口，药师刷卡或扫处方条码；智能存取系统根据处方内的药品存放位置运转；运转到相应位置，系统自动指示应取药品；药师根据系统提示和激光定位拿取药品。根据处方单核对药品信息将药品发放给患者；在空闲时间生成上药单；根据上药单，将二级库内药品上到智能存取设备内。